细菌耐药性的快速传播引起了广泛关注。船舶压载水直接导致了地理性隔离水域之间的水体交换，可作为致病菌和抗生素抗性基因（ARGs）等长距离迁移的载体。本文采用高通量测序和宏基因组学对船舶压载水中微生物群落和耐药基因的赋存分布情况进行了初步研究。结果表明，变形菌Proteobacteria、拟杆菌Bacteroidetes和放线菌Actinobacteria为压载水中的优势菌门，且变形杆菌在压载水细菌群落中占主导地位，尽管其组成在不同大陆和纬度间存在差异。痤疮丙酸杆菌Cutibacterium acnes、大肠埃希氏杆菌Escherichia coli和表皮葡萄球菌Staphylococcus epidermidis为压载水中最普遍的潜在致病菌。细菌多样性、致病菌丰度与港口连通性等社会经济因素之间存在显著的相关性。船舶压载水中共检测到700余种ARGs亚型，分属于氨基糖苷类、β-内酰胺、氯霉素、喹诺酮、磺胺、四环素等20多个类型，其中多重耐药类ARGs为压载水中最主要的ARGs类型。Procrustes分析表明，细菌群落对ARGs的影响要高于可移动遗传元件。产碱菌属、分枝杆菌属、黄色链霉菌属和假单胞菌属等潜在致病菌亦为压载水中ARGs的宿主菌。超过30%的ARGs宿主同时携带MGEs，水平转移风险较高。抗性风险指数显示，来自海上贸易路线关键点的船舶压载水中的ARGs风险明显高于其他地区。综上，本研究对合理评估船舶压载水的生态风险具有一定的指导意义。

船舶压载水，微生物群落组成，抗生素抗性基因